Το Πανεπιστήμιο Νεάπολις γίνεται το πρώτο πανεπιστήμιο στην Κύπρο που θα προσφέρει από την επόμενη ακαδημαϊκή χρονιά μεταπτυχιακό πρόγραμμα στις Θεολογικές Σπουδές. Το Πρόγραμμα αποτελεί σταθμό για την κάλυψη μεγάλων αναγκών της Εκκλησίας και της Εκπαίδευσης. Κληρικοί και λαϊκοί θεολόγοι, καθώς και δάσκαλοι, που διδάσκουν το μάθημα των θρησκευτικών, ή φιλόλογοι και πτυχιούχοι άλλων συναφών ανθρωπιστικών σπουδών, βρίσκουν άνετη διέξοδο στην επιμόρφωσή τους.
Το εν λόγω μεταπτυχιακό πρόγραμμα είναι εγκεκριμένο από το Υπουργείο Παιδείας και Πολιτισμού της Κύπρου. Ο τρόπος διδασκαλίας προσφέρει την δυνατότητα σε κάθε εργαζόμενο να το παρακολουθήσει αφού το κάθε εξάμηνο περιλαμβάνει συναντήσεις 13 Σάββατα. Η γλώσσα διδασκαλίας είναι η Ελληνική. Τα δίδακτρα για το 2011-2012 είναι €6.000. Το ποσό αυτό περιλαμβάνει το κόστος διδασκαλίας, πανεπιστημιακές σημειώσεις και τις διανυκτερεύσεις.